应用生物技术研究所成立于2008年，原名为高寒作物研究所，属校级研究所。经过多年建设与发展，已形成专业优势明显，能够服务地方的应用型科技团队，有着扎实的专业经验和研究基础。研究所主要研究内容为食品科学、生物制药、生态环保和生物医学工程。

团队成员现主要从事生态环保、生物材料及制品研发、食品营养与安全、畜禽营养与健康等方面的研究，致力于晋北地区土壤改良与修复、微生物种质资源挖掘和筛选、药用植物成分提取与功能成分研发、功能食品研发及抑菌敷贴与药物载体材料研发等研究与成果的示范推广、科技培训、服务咨询、人才培养、交流合作等工作。有退化土壤改良与生物调控大同市重点实验室1个市级科研平台。

现有教授3人、副教授9人、讲师5人。其中博士8人（含在读3人）、硕士3人；山西省三晋英才青年优秀人才2名，大同市科学技术带头人1人；山西大同大学硕士生导师4人。

研究所现有发酵罐、实时荧光定量PCR仪、PCR仪、土壤养分检测仪、微生物培养箱等多种仪器。先后主持和承担国家自然科学基金面上项目1项、青年基金项目3项，省、院、市各级科学研究和示范推广项目60余项，获国家专利16项，发表学术论文80余篇，主编、参编学术著作及本科教材15部。（数据截止2025年06月）