生物工程学科被学院批准为院级重点扶持学科。现有研究人员17人，其中：教授1人，副教授1人，讲师15人；具有博士学位者6人，其余均具有硕士学位。

本学科现有4个研究方向：（1）微生物及其基因资源方向：主要研究极端环境的微生物生态与生物多样性、微生物和宿主之间的关系。（2）发酵工程方向：主要研究药用微生物的产业化应用。（3）食品科学方向：主要研究微生物对于食品中大分子物质的作用机理。（4）生物制药方向：主要研究微生物制药及其产业化的应用。

近三年来，本学科研究人员主持和承担山西省科技攻关项目2项，山西省青年科学基金项目1项，大同市科技攻关项目1项，校级博士科研资助项目6项，在研经费近80万元。发表学术论文60余篇（其中SCI、EI收录论文10余篇）。获得国际先进鉴定成果1项。